Science Surf
But let your communication be Yea, yea; Nay, nay.
For whatsoever is more than these cometh of evil.
Search

Primary Menu

Skip to content
Genetics, Software

New R packages for SNP studies

5.12.2006 admin

The December R newsletter reports several brandnew bioconductor packages useful for SNP studies:

  • biomaRt: query Ensembl
  • beadArray: analyze Illumina arrays
  • RSNPper: query SNPper

more

Computer + SoftwareEnsemblGenetics + BiologyIllumina

Post navigation

Previous Post100 years of allergyNext PostNew LD measure

Impressum

Disclaimer

Most clicked

  • Nature Genetics corrupted by 23andme
    correspondence nature genetics Sir, the era of modern allergy genetics started in 1997 with the Transatlantic Airway Conference at Key Biscayne, Florida. 20 years later, the paper of Ferreira et al. (1) marks the end...
  • Image and text forensics
    I was looking for some simple tools for clone detection in pictures – unfortunately or luckily – there is no one button solution also in 2020. To extract the pictures I use unar (“brew install...
  • Der chinesische Menschenversuch
    Der geplante Tabubruch – eine kommentierte Presse- und Literaturschau. Montag 26.11.2018 Wir haben es lange gefürchtet, es wird ein verrückter Einzeltäter sein, der als erster einen genmanipulierten Menschen produzieren wird. Nature berichtet heute mittag über eine...
  • Eine Grenze zu setzen dem unendlichen Irrtum
    Galilei: Was geschieht? Federzoni: Die Nadel schwimmt! Heiliger Aristoteles, sie haben ihn niemals überprüft! Sie lachen. Galilei: Eine Hauptursache der Armut in den Wissenschaften ist meist eingebildeter Reichtum. Es ist nicht ihr Ziel, der unendlichen...
  • Zur Geschichte der Heilpraktiker
    Der im letzten Jahr verstorbene und nicht unumstrittene Münchner Toxikologie Daunderer schrieb auf seiner toxcenter Webseite über das Heilpraktikerwesen als ungeliebtes Hitlererbe: Kritiker halten die Existenz des Heilpraktikerberufs für einen Betriebsunfall der deutschen Geschichte. … Weil Deutschland...
  • LIMIT TO 5! What about a maximum of 5 papers per year per scientist?
    Undoubtly, there is an avalanche of poor research – as the Chronicle wrote last June, “we must stop the avalanche of low-quality research” the amount of redundant, inconsequential, and outright poor research has swelled in...
  • Die Ethik von Facebook
    Die mangelnde Bewusstsein von Facebook in ethischen Fragen war das immer wiederkehrende Problem von Cambridge Analytics bis zum Filterstream. Und nun finanziert Facebook plötzlich ein Ethik-Institut? Und niemand redet mehr über die Ethik von Facebook,...
  • Nylenna-Simonsen-Chalmers Misconduct Diagram
    The Lancet (10 June 2006, p 1882) had one of the best descriptions of scientific misconduct that I have ever seen (yes, I am also admiring Geoffrey Rose). The authors argue that our current view...
  • Cognitive bias codex
    I am sure, I wrote or talked about it before, but cannot find it. So here again –  a link to the cognitive bias codex plot of Terry Heick from https://www.teachthought.com (that is itself based on...
  • Das Problem des deutschen Ethikrates
    Das Problem des Ethikrates? Der Rat nimmt Stellung zu allen möglichen und unmöglichen Themen, kann aber häufig die Fakten in der kurzen Zeit nicht einordnen. Oder wertet sie mit nicht nachvollziehbaren Kriterien. Das war schon...

SEARCH

Special Collections

Climate & Crisis

Verkehr & NO2

Genome & Editing

Allergy & Farming

Daten & Schutz

Scientific & Misconduct

Adelsberger papers

Schweitzer papers

Allergy [RSS]

Genetics [RSS]

Joke [RSS]

One World [RSS]

Philosophy [RSS]

Software [RSS]

Theology [RSS]

Video [RSS]

Vitamin D [RSS]
New R packages for SNP studies
https://www.wjst.de/blog/sciencesurf/2006/12/new-r-packages-for-snp-studies/
(c) Science Surf, Matthias Wjst
published 5.12.2006, accessed 21.02.2020