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Allergy

Was ist die Leitlinie zur Immuntherapie von Allergien wert?

Leitlinien sollten nicht von eigenen Interessen gesteuert sein. Das gilt alle Leitlinien genauso wie Leitlinie “Allergen-spezifische Immuntherapie bei IgE – vermittelten allergischen Erkrankungen”.

Der Markt ist hier allerdings – wohl durch die Therapieallergene-Verordnung (TAV) – stark in Bewegung, da die Hersteller kostenintensiven Zulassungsverfahren durchführen müssen.
Allergenhersteller sind dabei traditionell schon immer stark als Sponsoren auf Allergiekongressen vertreten, einer Randsparte der klinischen Medizin, wo es kaum pharma-unabhängige Experten gibt.

Zu diesem Schluss kommt auch leitlinienwatch.de, eine Initiative, die vor zwei Wochen im deutschen Ärzteblatt vorgestellt wurde.

Das Portal wertet den Umgang mit Interessenkonflikten bei der Leitlinienerstellung kontinuierlich aus und bewertet die Ergebnisse. Ziel der Initiative ist es, den Einfluss von Interessenkonflikten auf medizinische Behandlungsleitlinien zu reduzieren. Leitlinienwatch.de will Best-Practice-Beispiele identifizieren und den Fachgesellschaften ein konstruktives Feedback mit Verbesserungsvorschlägen für anstehende Revisionen geben.

Die Initiative ist eine Gemeinschaftsaktion von Mezis („Mein Essen zahl’ ich selbst – Initiative unbestechlicher Ärztinnen und Ärzte“), Neurology First und Transparency International, alles Organisationen, die sich gegen die Einflussnahme der Pharmaindustrie auf das Handeln von Ärztinnen und Ärzten wenden.

Diese unabhängige Einschätzung der Leitlinie zur Immuntherapie ist gelinde gesagt verheerend mit nur 4 von 18 möglichen Punkten. Im Detail finden die Autoren

Das Statement, dass “keine Interessenkonflikte festgestellt wurden, die die fachliche Unabhängigkeit der Autoren im Hinblick auf die Erstellung der Leitlinie beeinträchtigen könnten” überzeugt angesichts der zahlreichen Beraterverträge mit den Herstellern der bewerteten Medikamente nicht.

Die Leitlinie beruht dabei zu einem nicht unbeträchtlichen Teil auf Studien und Reviews der derselben Autoren. Honi soit qui mal y pense.

 

CC-BY-NC Science Surf accessed 20.01.2026
Genetics

Gesund und krank: Diskriminierung bei Bipolar I Störung

Die Bipolar-I-Störung ist eine chronisch verlaufende psychiatrische Erkrankung, früher auch als manisch-depressive Psychose bezeichnet und gehört zu den affektiven Störungen. Kennzeichen der Erkrankung sind wiederholte manische und depressive Episoden, seltener einer Mischung aus beiden, sowie lange Phasen von unauffälligem, situativ angepasstem Verhalten (LUNDBECK.COM). “Menschen mit Bipolar-I-Störung können ungewöhnlich intensive Stimmungen haben, die jeweils über einen bestimmten Zeitraum anhalten, der als ‘Episode’ bezeichnet wird.” Continue reading Gesund und krank: Diskriminierung bei Bipolar I Störung →

 

CC-BY-NC Science Surf accessed 20.01.2026
Software

2.225074e-308

I have recently read in a dataset with p<10e343 that has been set to zero. So here is what the R documentation says

.Machine
# the smallest non-zero normalized floating-point number, a power of the radix, i.e., double.base ^ double.min.exp.
$double.xmin
2.225074e-308
# the largest normalized floating-point number. Typically, it is equal to (1 - double.neg.eps) * double.base 
# ^ double.max.exp, but on some machines it is only the second or third largest such number, being too small 
# by 1 or 2 units in the last digit of the significand
$double.xmax
1.797693e+308

 

CC-BY-NC Science Surf accessed 20.01.2026
Allergy

München Flughafen Spengstoffkontrolle

Der neue SZ Bericht über die Beschwerden der Angestellten am Münchner Flughafen ist technisch nicht sehr ergiebig. Alles nur Sick Building Syndrom? Auch wenn von anderen Flughäfen keine solchen Symptome bekannt sind, kann es unter spezifischen Umgebungsbedingungen anders aussehen: andere Substrate, Gerätedefekte, Fehlbedienung. Im Prinzip wird eine Wischprobe genommen.

der Streifen wird anschließend in einem Analysegerät untersucht. Zwei Hochgeschwindigkeits-Gaschromatographen lösen die Sprengstoffe aus der Probe. Die Geräte erkennen so in 15 bis 18 Sekunden kleinste Mengen Sprengstoff und zwar schon ab der Menge von 100 Piktogramm.

Nach Presseberichten kommen zwei Arten von Gaschromatographen zur Anwendung: Itemizer 4DX und Quantum Sniffer QS-B220. Falls es dabei zu einer Luftionisation kommt, könnte man Ozon messen oder auch das Trockenmittel auf allergene Potenz untersuchen. Oder ganz einfach mal alle Geräte zwischen Frankfurt und München tauschen.

 

CC-BY-NC Science Surf accessed 20.01.2026
Software

Under fire

These messages look innocent but they are a constant invasion into privacy. Google tries to match all devices to a single person.

 

CC-BY-NC Science Surf accessed 20.01.2026
Philosophy

Racist comments

I just received a Google alert of a new paper that cites our earlier work. The authors describe a Twitter analysis””23andMe confirms: I’m super white“. It showcases a lot of noise …

The two most popular DTC companies, 23andMe and AncestryDNA, also generate the most tweets. However, al-though 23andMe has half the customers, it produces almost 5 times more tweets, which is also due to controversy around their failure to get FDA approval in 2015.

and even more noise

In particular, the “ethnic” breakdown provided by ancestry reports seems to spur several instances of negative sentiment tweets associated with racism and disapproval of multi-cultural/multi-ethnic values. For instance, a user with more than 3K followers self-describing as a “Yuge fan for Donald Trump”, tweets: “Get this race mixing shit off my time line!!” in response to a 23andMe video about ancestry […] Also, Twitter might be removing tweets with hate words as claimed in their hateful conduct policy. Nonetheless, we do find instances of hate speech, e.g., antisemitic tweets […]

This what I already feared, the largely useless genetic testing is being misused for inferior interests. It is dangerous too, just read the recent case history.

 

CC-BY-NC Science Surf accessed 20.01.2026
Allergy, Genetics

Vitamin D buffering

Response to oral vitamin D seems to be different in humans . How do we buffer (artificial) vitamin D intake?

Vitamin binding protein or group specific component GC is a good candidate.  GC regulates the bioavailability of 25(OH)D3, acting as the main transporterint he blood stream from liver to kidney.  As described earlier GC binds with high affinity to 25(OH)D3, leaving less than 1% of circulating 25(OH)D3 free. In contrast to 25(OH)D3, which has a half-life of several weeks, GC  has a short half-life of 3 days only, suggesting that the protein and its ligand are independently regulated. Also the free binding capacity  of GC is variable. In addition there are GC variants that have different binding characteristics. Depending on these isoforms, serum levels increased between 97% and 307% after receiving 600 or 4000 IU/d vitamin D3 for one year. Taken together GC is assumed to be a buffer of vitamin D effects (and side effects) whenever transport in the blood stream is being involved.

The most recent GWAS study now shows again skyrocking p-values of GC variants and serum 25(OH)D3.

It is long known, that two missense variants of GC locate in exon 11. rs7041 encodes Asp432Glu pr D432E and rs4588 encodes Thr436Lys or T436K. These amino acid exchanges are leading to electrophoretically distinguishable proteins Gc1F/Gc1S and Gc2 respectively.  We are  moving the following gene plot bottom up to match the orientation.

Unfortunately LD is extremely high at GC. The GWAS peaks are therefore in the first intron, at exon 11 and intron 12. Lets’ s get closer to exon 11 where the two most important SNPs reside.

Although both variants are listed at many SNP chips I  can find only results for rs7041 with p=10^-222 in the new dataset.

rs7041 is listed as a A->C SNP there but according to Fu 2009 it is definitely a G->T variant. Also SNPedia has numerous articles for rs7041 being  a G->T exchange, for example Suaini 2014

This is also confirmed by dbsnp.  The GAT -> GAG exchange  is equivalent to D -> E, so the online results report a wrong strand orientation. Unfortunately we are stuck here, as one of the main effect SNP seems to have an unclear allele assignment and the second most important SNP is missing from the meta-analysis.

What would be nice is  a conditional analysis based on rs7041/rs4588 haplotypes. I predict there are further unknown functional variants in GC.  Maybe in intron 1 that often contains regulatory elements at the 5′-site of the intron. As the strongest signal is in the last intron and even beyond the 3′- end, further studies of 3′-UTR would be interesting, looking for binding sites of regulatory proteins, some miRNA or AU rich elements that affect the stability or decay rate of the transcript.

 

CC-BY-NC Science Surf accessed 20.01.2026
Philosophy, Theology

Ethik ohne Ethiker

Die Zeiten sind eigentlich vorbei, in denen Nobelpreisträger qua ausgezeichnetem Verstand über die Welt räsonierten. Oder die Zeiten, wo man gerade mal so nebenbei eine Ethik auf den Markt wirft.
Vorteile hat es allemal. Man kann kostengünstig von aktuellen Problemen ablenken, Freiräume schaffen und nebenbei auch noch Akzeptanz promoten, man ist politisch engagiert.
Worum es geht? Ein Wissenschaftskodex, so nebenbei auf dem Weltwirtschaftsforum erstellt. Continue reading Ethik ohne Ethiker →

 

CC-BY-NC Science Surf accessed 20.01.2026
Genetics, Vitamins

Genetics of vitamin D

A new GWAS of vitamin D serum level reports two new loci as sample size could be increased from 16K to 79K. While the previous GWAS hits had a reasonable biological function (GC transport protein,  DHCR7 converting to cholesterol, CYP2R1  to calcidiol and CYP24A1 degradation)  the new loci look more like statistical artifacts.
The authors tried some kind of dose effect estimates

where SNP effects on serum level became slightly weaker (which makes sense as diet is a clear environmental factor). Continue reading Genetics of vitamin D →

 

CC-BY-NC Science Surf accessed 20.01.2026
Philosophy

Forgetting curve

There are news on the “forgetting curve”

In 1885, Hermann Ebbinghaus collected data to plot a forgetting curve. Today, we approximate forgetting with an exponential curve where R is retrievability (a measure of how easy it is to retrieve a piece of information from memory), S is stability of memory (determines how fast R falls over time in the absence of training, testing or other recall), and t is time.

The Atlantic now adds to this

In the internet age, recall memory—the ability to spontaneously call information up in your mind—has become less necessary. It’s still good for bar trivia, or remembering your to-do list, but largely, Horvath says, what’s called recognition memory is more important. “So long as you know where that information is at and how to access it, then you don’t really need to recall it,” he says … Socrates hates writing because he thinks it’s going to kill memory,” Horvath says. “And he’s right. Writing absolutely killed memory. But think of all the incredible things we got because of writing. I wouldn’t trade writing for a better recall memory, ever.” Perhaps the internet offers a similar tradeoff: You can access and consume as much information and entertainment as you want, but you won’t retain most of it.

 

CC-BY-NC Science Surf accessed 20.01.2026