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Open Location Code

8.11.2024 admin

After many years of using OsmAnd, a much shorter time using Maps With Me and for the last few years Guru Maps , I went back to OsmAnd last week. It can finally export GPX also on the road to feed my old Wahoo Elemnt Bolt which is still one of the best devices with its low energy consumption.

OsmAnd can now even create an overlay with Google Earth map tiles by going from Menu > Configure Map > Map Source > New

Name: Google Earth
Url: <a href="http://mts0.googleapis.com/vt/lyrs=s&amp;x={1}&y={2}&z={0}">http://mts0.googleapis.com/vt/lyrs=s&amp;x={1}&amp;y={2}&amp;z={0}</a>
Zoom: 1-18
Expiry: 259200 (0.5 year)

I was only struggling to import POIs from Google Maps or iOverlander but even this works when using Open Location Codes or

Plus codes are designed to be used like street addresses and may be especially useful in places where there is no formal system to identify buildings, such as street names, house numbers, and post codes. Plus codes are derived from latitude and longitude coordinates, so they already exist everywhere.[5] They are similar in length to a telephone number (e.g., 849VCWC8+R9) but can often be shortened to only four or six digits when combined with a locality (e.g., CWC8+R9, Mountain View, California).

Noteworthy

Academia in a stranglehold?

8.11.2024 admin

ukrant.nl has an interesting article about the publishing industry

And that gives them far more information than you might realise. When Eiko Fried, a psychologist from the University of Leiden, asked Elsevier for his personal data in December 2021, he received an email with hundreds of thousands of data points, going back many years.

He discovered that Elsevier knew his name, his affiliations and his research. That his reviews had been registered, as well as the requests for peer review he had declined. Elsevier kept track of his IP-addresses – leading back to his home – his private telephone numbers, and the moments he logged in, which showed exactly when he worked and when he was on vacation. There were websites he visited, articles he had downloaded or just viewed online. Every click, every reference was recorded.

Allergy

I couldn’t resist

7.11.2024 admin

to ask also chatGPT consensus some of my lifelong research questions

nothing wrong here but clearly not weighted at all. Maybe the consensus app need to learn also rules of meta-analysis and evidence based research in particular when attention to the details is decisive for epidemiology, immunology and clinical studies.

One World

Triple Therapie bei Adipositas

7.11.2024 admin

Das Prinzip “viel hilft viel” wird ja schon lange diskutiert, etwa Mehnert 2014 mit Metformin plus DDP4 und SGLT2-Rezeptor-Hemmer. Und dann wieder Tschöp 2020 mit Triple Agonisten GIP, GLP-1 und Glukagon.

Die Entdeckung der Doppel- und Dreifach-Darmhormon-Ko-Agonisten … hat zu einer Reihe neuer Therapeutika in klinischer Entwicklung geführt. Der erste Ko-Agonist an den Rezeptoren für GLP-1 und GIP wurde kürzlich von der FDA zur Behandlung von Typ-2-Diabetes zugelassen und verbessert das Körpergewicht und den Glukosestoffwechsel bei höherer Sicherheit und Wirksamkeit als GLP-1 Monotherapien.

Aber das Rennen hat nun doch jemand anderes gemacht – Lotte Bjerre Knudsen mit einer geschmähten GLP-1 Monotherapie.

Auch Novo hatte mit GLP-1 zu kämpfen und konnte bis Mitte der 1990er Jahre nur wenig vorweisen. Knudsen, die mit einem letzten Versuch betraut wurde, das Hormon in den Griff zu bekommen, wandte eine proteintechnische Strategie der Fettsäure-Acylierung an, um die Halbwertszeit des Hormons zu verlängern, und erfand das einmal täglich einzunehmende GLP-1-Analogon Liraglutid. Dreißig Jahre später ist der einmal wöchentlich einzunehmendes GLP-1-Analogon Semaglutid ein medizinisches und kommerzielles Phänomen, mit einem Umsatz von über 18 Milliarden US-Dollar im letzten Jahr im Bereich Diabetes und Adipositas.

Interessant ist für Novo allenfalls die Kombination mit einem Amylin Rezeptor Antagonisten. Amylin ist ein weiteres Pankreas Hormon das mit Insulin sezerniert wird, die Magenentleerung verzögert und zu dem die postprandiale Glukagonfreisetzung verhindert,

Auch die neueste Novo Errungenschaft NK2R Aktivierung ist eine Monotherapie…

Noteworthy

Il buono, il brutto, il cattivo

7.11.2024 admin

Das Gute, das Schlechte und das Hässliche.

Es ist kein guter Tag für Wissenschaft, weder in den USA wo wieder gewählt wurde aber auch nicht in Deutschland, in dem nun die Regierung zerbrochen ist.

Dabei – so das Ärzteblatt diese Woche – sagt doch das neue Wissenschaftsbarometer wie wichtig Wissenschaft ist

… Umgekehrt schätzt beinahe jeder zweite Befragte den Einfluss der Wissenschaft auf die Politik als eher zu gering/viel zu gering ein. Das geht aus dem heute veröffentlichten Wissenschaftsbarometer 2024 hervor.
Die Frage, wie es hierzulande um die Wissenschaftsfreiheit steht, beantworteten 39 Prozent der Befragten mit „teils, teils“. Rund ein Drittel (32 Prozent) hält sie für „eher gut“, „sehr gut“ sagten 13 Prozent.
Bei Personen mit hohem formalem Bildungsniveau ist das Vertrauen deutlich ausgeprägter (75 Prozent) als bei mittlerem und niedrigem formalem Bildungsniveau. Der Grund, dem die Befragten am häufigsten als Grund für ihr Misstrauen zustimmten, war die Aussage: „Weil Wissenschaftler stark abhängig von ihren Geldgebern sind.“

Und wo ist nun das Gute an allem?

Die Wissenschaftsministerin wird nun endlich zurücktreten nachdem sie wie kaum jemand vor ihr im BMBF die Scheiben zerschlagen hat. SZ:

Die FDP zieht ihre Minister aus der Bundesregierung zurück. Sie wollten ihren Rücktritt geschlossen beim Bundespräsidenten einreichen, sagte Fraktionschef Christian Dürr. Das Dreierbündnis ist damit zu Ende. Im Kabinett saßen für die Liberalen vier Minister – neben Christian Lindner (Finanzen) noch Volker Wissing (Verkehr), Marco Buschmann (Justiz) und Bettina Stark-Watzinger (Bildung und Forschung).

Während Wissing sich mit seinem FDP Austritt allgemeinen Respekt erworben hat, ist die Bilanz von Stark-Watzinger verheerend. Jan-Martin Wiarda schreibt

So schnell kann es gehen mit dem Rücktritt einer Ministerin, den sie eben noch in der Fördermittelaffäre so vehement abgelehnt hatte… Alles zu Ende, alles vorbei? Stillstand in der deutschen Wissenschaftslandschaft bis zur Konstituierung einer neuen Regierung, wohl frühestens im Sommer nächsten Jahres? Kein Wissenschaftszeitvertragsgesetz (WissZeitVG). Kein Forschungsdatengesetz. Keine DATI [Deutschen Agentur für Transfer und Innovation]? Keine Novelle des Aufstiegsfortbildungsförderungsgesetzes. Kein Digitalpakt für die Schulen.

20.11.2024

Wie es weiter geht? Wir wissen es nicht.

3.12.2024

Stark-Watzinger ist endlich zurück getreten.

Bettina Stark-Watzinger durfte die große politische Bühne über den Nebenausgang verlassen. Am Mittwochabend, kurz nach dem Koalitionsbruch, teilte sie ihren Rücktritt mit, der in der Wissenschaft zuvor schon tausendfach gefordert worden war. … Das Vertrauen der Wissenschaft in die Ministerin war spätestens nach der Fördergeldaffäre irreparabel beschädigt. Man wartete auf den Nachfolger.

Aber was ist nun mit den Wire Daten? Ich tendiere zur

dritten Möglichkeit, die Bundesregierung hat von diesen Chats keine Kenntnis, weil sie gar nicht auf “Wire Bund”, sondern auf der privaten Wire-App stattfanden. Was in dem Augenblick ein Verstoß gegen die Vorschriften wäre, wo, und seien es nur zum Teil, doch dienstliche Belange und Zwecke diskutiert worden sein sollten.

Philosophy

Fake degrees from fake universities

6.11.2024 admin

Unfortunately there are so many lies, there is so much fraud in science. And science is a big business according to a new report

According to Hesselbäck, in Sweden it’s not illegal for a job applicant to submit qualifications from a fake university, although it is a crime to forge an academic transcript or degree from a legitimate university. The relevant laws vary by country.

Occasionally I had doubts on MD/PhD or professoral titles shown on badges while it is particular annoying if legal and illegal titles are even mixing…

In Norway, he adds, it is a criminal offence to submit credentials from a fake university, but the burden of proof has to be strong. At the federal level, the United States does not explicitly prohibit the issuing, holding or advertising of bogus degrees, although some states have laws banning them. In practice, individual holders of phoney medical degrees have surrendered their licences or been removed from their positions.

Philosophy

elife delisted

31.10.2024 admin

Elife is one of the most interesting scientific journals with a full history at Wikipedia. The Elife board introduced in 2022 that

From next year, eLife is eliminating accept/reject decisions after peer review, instead focusing on public reviews and assessments of preprint

with the unfortunate but foreseeable consequence that Elife now does not get anymore an impact factor

Clarivate, the provider of the Web of Science platform, said it would not provide impact factors to journals that publish papers not recommended for publication by reviewers.

I don’t care about impact factors. I also do not care about Clarivate or any other Private-Equity-company as we don’t need this kind of business in science. Elife however will loose it’s value in particular as system still has some flaws.

DeevyBee commented already about them a year ago

there is a fatal flaw in the new model, which is that it still relies on editors to decide which papers go forward to review, using a method that will do nothing to reduce the tendency to hype and the consequent publication bias that ensues. I blogged about this a year ago, and suggested a simple solution, which is for the editors to adopt ‘results-blind’ review when triaging papers. This is an idea that has been around at least since 1976 (Mahoney, 1976) which has had a resurgence in popularity in recent years, with growing awareness of the dangers of publication bias (Locasio, 2017). The idea is that editorial decisions should be made based on whether the authors had identified an interesting question and whether their methods were adequate to give a definitive answer to that question.

So the idea is that the editors get the title and a modified abstract with no author names and without results.

Noteworthy

Drosophila’s brain

30.10.2024 admin

I couldn’t agree more with the comment on the new brain mapping study where the comments reminds me to many critical comments on the Human Genome Project

Analogies to whole-genome sequencing are apt: neither the genome nor the connectome alone can solve the problem, but they provide a structural foundation from which functional insights can arise.

Noteworthy, Software, Tech

More AI headlines

27.10.2024 admin

-1-

While we are still waiting for the Nobel prize speech of Geoffrey Hinton in December, AI makes even more negative headlines.

[Hinton] “I worry that the overall consequences of this might be systems that are more intelligent than us that might eventually take control.” He also said he uses the AI chatbot ChatGPT4 for many things now but with the knowledge that it does not always get the answer right.

-2-

The sheer power consumption of running AI models is frightening. Nature News asks if AI’s huge energy demands will spur a nuclear renaissance

Google announced that it will buy electricity made with reactors developed by Kairos Power, based in Alameda, California. Meanwhile, Amazon is investing approximately US$500 million in the X-Energy Reactor Company, based in Rockville, Maryland, and has agreed to buy power produced by X-energy-designed reactors due to be built in Washington State.

-3-

A former OpenAI employee talks on his blog how AI is using copyrighted material eg stealing content.

While generative models rarely produce outputs that are substantially similar to any of their training inputs, the process of training a generative model involves making copies of copyrighted data. If these copies are unauthorized, this could potentially be considered copyright infringement, depending on whether or not the specific use of the model qualifies as “fair use”. Because fair use is determined on a case-by-case basis, no broad statement can be made about when generative AI qualifies for fair use. Instead, I’ll provide a specific analysis for ChatGPT’s use of its training data, but the same basic template will also apply for many other generative AI products.

Effects can be measured only indirectly for example by the visitor count at Stack Overflow where the traffic declined as many user (including me) don’t need Stack Overflow anymore.
Here is another phantastic discussion over at PP between Henry Leirvoll and 495yt on the very basic questions of copyright.

humans get inspired (parsing the external examples or experiences through their inner understanding and individual perspective) they start working to make something with their tools, skills, time and purpose. the result represents the author, their influences and their message.
a lot of this process is protected by copyright.
ai is not inspired. and it has no personal perspective or tools. no message to transmit.
any message put into prompts by an ai user is translated by it’s LLM layer into other, more complex prompts, which also get treated quasi-randomly by the weights and biases of the model, as well as rand seeds.

-4-

And well, ChatGPT can produce malicious code even with all precautions: Researchers Bypass AI Safeguards Using Hexadecimal Encoding and Emojis

If a user instructs the chatbot to write an exploit for a specified CVE, they are informed that the request violates usage policies. However, if the request was encoded in hexadecimal format, the guardrails were bypassed and ChatGPT not only wrote the exploit, but also attempted to execute it “against itself”, according to Figueroa.

Noteworthy

The Elsevier history

26.10.2024 admin

is now at X

https://x.com/NicoGagelmann/status/1847631539263123905

I saved a dynamic screenshot just in case it’s gone with X in the near future.

Noteworthy

Alternatives to Google Scholar

24.10.2024 admin

Kirsten Elliott has an interesting blog post

There are alternatives to Google Scholar which operate from an open research ethos and are free to use. Three prominent alternatives are The Lens, Matilda and OpenAlex. The one I’ve used most is OpenAlex. One study has found it to have comparable coverage to Web of Science and Scopus, and my own limited testing found significantly more publications indexed from social sciences and humanities subjects. Their code is fully open, and the data is reusable.

not as good as Google but usable

Noteworthy

COVID-19 Mortalität IX: Doppelt so hohe Krankenhausmortalität in Deutschland als in der Schweiz

24.10.2024 admin

Ich hatte in einer eigenen Studie vermutet, daß die viel höhere Beatmungsrate von Stefan Kluge in Hamburg zu einer doppelt so hohen Mortalität führte.

Nun kommt eine unabhängige Studie im Vergleich zwischen Deutschland und der Schweiz zu einem nahezu identischen Ergebnis.

The in-hospital mortality was significantly higher in Germany than in Switzerland (21% vs. 12%, OR 2.0, 95% CI 1.9–2.0, p < .001). Matched cohorts showed reduced differences, but Germany still exhibited higher in-hospital mortality. Discrepancies were evident in both pre-pandemic and pandemic analyses, highlighting existing disparities between both countries […] The fact that a higher pre-pandemic in-hospital mortality rate was observed in Germany with a comparable mechanical-ventilation rate suggests that there might be reasons other than the pandemic.

Ursache ist natürlich die Indikation zur Beatmung. Und das obwohl wir es schon ziemlich früh in der Pandemie besser wussten dank Thomas Voshaar in Moers, siehe auch

COVID-19 Mortalität VIII: Hamburg reloaded

COVID-19 Mortalität VII: ICUs in Deutschland

COVID-19 Mortalität VI: Was hat sich an der S3 Leitlinie geändert?

COVID-19 Mortalität V: Vergleich Schweiz/Österreich

COVID-19 Mortalität IV: Wie wir sie senken könnten

COVID19 Mortalität III: Wie gut ist die Leitlinie zur Beatmung?

COVID-19 Mortalität II: Hamburg und München im Vergleich

COVID-19 Mortalität I: Wieso ist die Mortalität In Deutschland so unterschiedlich?

Christian Karagiannidis in seiner letzten Publikation vermeidet wohlweislich meinen Ortsvergleich, kommt am Ende aber nicht umhin, die Übertherapie aus wirtschaftlichen Gründen zu kritisieren – reichlich verklausuliert – daß nämlich eine neue „Indikationsqualität zur Aufnahme auf die Intensivstation“ notwendig ist.

Philosophy

Scientific integrity is now included in the Helsinki Declaration

23.10.2024 admin

JAMA has a new revision of the Helsinki Declaration. Compared to the 2013 version there is now a new chapter on scientific integrity

Scientific integrity is essential in the conduct of medical research involving human participants. Involved individuals, teams, and organizations must never engage in research misconduct.

Additional details can be found in an Editor’s note and my comments are at Retraction Watch.