Spät-Intubation
In Deutschland gibt es zwei Wissenschaftler, die den Verlauf der Corona Pandemie massgeblich beeinflusst haben.
Der eine ist sehr bekannt, hat massgeblich die Strategie der Bundesregierung beeinflusst. Der zweite ist eher unbekannt, dafür verdankt ihm Deutschland die niedrige Mortalitätsrate: Dr. Thomas Voshaar.
Hier die Erklärung im O-Ton, warum die Mortalität hierzulande so viel geringer ist als in anderen Ländern.
Das Thema wurde auch in der Tagesschau und Monitor aufgegriffen und – logisch – von Anästhesisten kritisiert. Pathophysiologie und Mortalität in England und USA sprechen aber eindeutig gegen die Einwände.
Deep fake science
I am currently working on a lecture how I make up my mind whenever approaching a new scientific field. Of course we get the first orientation by proven experts, by proven journals and textbooks, then we collect randomly additional material just to increase confidence.
But what happens if there is some deep fake science? A new Forbes article highlights now deep fakes, how they are going to wreak havoc on society and “we are not prepared”
While impressive, today’s deepfake technology is still not quite to parity with authentic video footage—by looking closely, it is typically possible to tell that a video is a deepfake. But the technology is improving at a breathtaking pace. Experts predict that deepfakes will be indistinguishable from real images before long. “In January 2019, deep fakes were buggy and flickery,” said Hany Farid, a UC Berkeley professor and deepfake expert. “Nine months later, I’ve never seen anything like how fast they’re going. This is the tip of the iceberg.”
It means that also empirical science can be manipulated as well which will be even hard to detect.
Sugar daddy science
Der Begriff ist nicht neu, er wurde wohl 2019 von der Zeitschrift Atlantic erstmals in das allgemeine Bewusstsein gerückt für Forschung die direkt – ohne Ausschreibung, Wettbewerb oder Review – finanziert wird. Damals war es das MIT Media Lab, das “Spenden” von Jeffrey Epstein angenommen hat. Das muss nicht per se fragwürdig sein, hinterlässt aber doch ein ungutes Gefühl, warum gibt jemand sein Geld für Forschung aus?
Auch jetzt in Corona Zeiten, scheint es wieder in Mode zu kommen, dass einfach mal Geld aus der Staatskasse überwiesen wird: 1.000.000€ von Markus Söder an die LMU plus weitere Finanzierung an die Uni Regensburg, 65.315 € von Armin Laschet an die Uni Bonn, Winfried Kretschmann an vier Unis in Baden Württemberg in unbekannter Höhe, 2.000.000€ von Stephan Weil an die Uni Hannover “um in den kommenden zwei Jahren Bioproben und Daten von 1.000 unterschiedlich stark am Coronavirus SARS-CoV-2 erkrankten Patienten zu sammeln”.
Das Ganze ist natürlich ein Witz, wenn nun die Unikinderklinik Freiburg schon beklagt, dass sie nicht mehr genügend Patienten für ihre Studie findet. Und wo sollen mit aktuell 54 Neuerkrankungen in Niedersachsen die 1000 Fälle für eine Biobank herkommen? Wo sich doch längst vor Monaten ein internationales Konsortium zu der Frage gebildet hat und es nun wirklich nicht die primäre Frage ist, ob eine Genvariante das Risiko um das 1.1 fache erhöht. Mit dem nächsten Virus ist sowieso wieder alles anders.
Und sollten die Studien nicht helfen, die Containment Massnahmen zu steuern? Ausser der Gangelt Studie kenne ich keine einzige offizielle Zahl obwohl vor genau 4 Monaten der erste Fall in München beschrieben wurde. Nach den letzten Presseberichten werden die Ergebnisse der sugar daddy Studien hinter verschlossenen Türen dafür hergenommen um die lokale Politik zu rechtfertigen, ohne dass sie irgendjemand überprüfen kann. Vielleicht ist das auch besser so, denn wir wären wahrscheinlich von der Qualität enttäuscht, da kann ich mich nur Antes in der Lagebeurteilung vom 25.5. anschliessen
Ja, es gibt ein klareres Bild von der Unklarheit. Es gibt leider extreme regionale Unterschiede. Das war die Hauptkritik an der Heinsberg Studie mit ihren 14 oder 15 Prozent Dunkelziffer. Wenn ich in einen Hotspot fahre, bilde ich natürlich das ab, was vor Ort passiert ist. Es ist aber ohne jede Aussagekraft für das ganze Land … Die verschiedenen Massnahmen sind so miteinander vermengt, dass man das nicht differenzieren kann. Wir gehen leider mit allen Fehlern der Welt zurück in die Öffnung. Es ist ein Abschied von der Wissenschaft, den wir gerade sehen. … Wir haben weltweit etwa 1100 sichtbare Studien zum Thema Corona. In Deutschland scharren auch alle mit den Hufen … um Studien durchzuführen. Leider aber gibt es keine Führungsstruktur, die diese Anstrengungen koordiniert. Meine größten Vorwürfe gehen in dieser Hinsicht an das Bundesforschungsministerium, von dem man fast nichts hört. Wir bräuchten für Deutschland einen Masterplan von Fragen. Dann müsste man diese Aufgaben verteilen und die Ergebnisse zusammenfassen, damit diese Entscheidungen dienen können. Dafür muss sich Wissenschaft allerdings koordinieren lassen.
Datenschutz in Hongkong
In #HongKong kann man auf einer regelmäßig aktualisierten Map sehen, wo jede*r einzelne #COVID19-Infizierte wohnt, sowie sein*ihr Alter und Geschlecht erfahren. /via @laurelchorhttps://t.co/gheud3s8nX
The phantom herd immunity to covid-19
When most of a population is immune to an infectious disease either by natural infection or by vaccination, this provides indirect protection — or herd immunity — to those who are not immune to the disease.
A positive antibody response does not necessarily mean that there is immunity but nevertheless it may give a first indication how many individuals may have had contact with a virus. Be aware of several infodemic websites on seroprevalence. Also note that most information is distributed by news agencies, press offices and preprints only bypassing usual standards in science. Unfortunately also most tests have not been properly standardized.
| country | date | N | representative | antibody prevalence % | method | Link |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Wuhan, China | 2Apr20 | 1.401 | no | 10 | ? | journal |
| Robbio, Italy | 6Apr20 | 2.000? | no? | 13.5 | ? | link to Ref 24 by Bendavid not working |
| Telluride, USA | 8Apr20 | 986 | ? | 0.8 | ? | newspaper |
| Santa Clara, USA | 17Apr20 | 3.330 | no (Facebook) | 1.5 | Premier Biotech, Minneapolis | medrxiv<> |
| Netherlands | 15Apr20 | 7.361 | no (plasma donors) | 3.1 | Wantai Biological Pharmacy | NIH |
| Los Angeles, USA | 20Ap20 | 863 | yes? | 4.1 | ? | press release |
| Trieste, Italy | 22Apr20 | 727 | no (clinic staff) | 17.2 | Wantai SARS-CoV-2 Ab Rapid Test | medrxiv |
| Brevard, USA | 24Apr20 | 1000 | no? | 1.0 | ? | newspaper |
| Miami, USA | 14Apr20 | 1.800 | yes | 4.4-7.9 | ? | press release |
| Scotland, GB | 17Apr20 | 1.000 | no (blood donors) | 1.0 | neutralisation assay | medrxiv |
| Chelsea, USA | 17Apr20 | 200 | no (passengers) | 32 | ? | newspaper via Science |
| New York, USA | 27Apr20 | 7.500? | ? | 15.0 | ? | newspaper |
| Denmark | 28Apr20 | 9,496 | no (blood donors) | 1.7 | Livzon Diagnostics IgM/IgG | medrxiv |
| Germany | May20 (weekly) | 1.342 | yes | 1.0 | ? | RKI> |
| Iran | 1May20 | 551 | yes | 22 | VivaDiag COVID‐19 VivaCheck | medrxiv |
| Barcelona, Spain | 2May20 | 578 | no (healthcare worker) | 9.3 | Luminex / Krammer | medrxiv |
| Gangelt, Germany | 4May20 | 919 | no (hotspot) | 14.1 | Euroimmun? | UK Bonn |
| Padova, Italy | 1May20 | 133 | no (health care worker) | 5.3 | Chemiluminescence | medrxiv> |
| San Miguel County, USA | 1May20 | 5.455 | ? | 0.5 | UB? | website |
| Philadelphia, USA | 9May20 | 237 | no (patients) | 5.9 | own ELISA / Florian Krammer | researchsquare |
| Boise, USA | 7May20 | 4.856 | no (self selected) | 1.8 | Abbott SARS-CoV-2 IgG | journal |
| Kobe, Japan | 5May20 | 1.000 | no (outpatients) | 3.3 | RC-NC002, KURABO | medrxiv |
| Wake Forest, USA | 8May20 | 676 | no (former patients) | 2.2 | ? | newspaper |
| Lausanne, Schweiz | 6May20 (weekly) | 1.335 | yes | 3.1, 6.1, 9.7 | Euroimmun | medrxiv |
| Brazil | 10May20 | 4.188 | yes | 0.05, 0.13 | Wondfo Biotech | medrxiv<7a> |
| Singapore | 12May20 | 32.000 | no (workers in dorms) | ? | ? | newspaper> |
| Berlin, Germany | 13May20 | 5.000 / 7.500 | no (Charité staff) | 2.3, 0.3 | ? | Ärzteblatt |
| Spain | 15May20 | 60.000 | yes (?) | 5.0 | ? | Reuters |
| Cambridge, UK | 15May20 | 1.032 | no (health care worker) | 3.0 | own protocol | medrxiv |
| Hannover, Germany | 18May20 | 217 | no (health care worker) | 1.0 | Euroimmun | medrxiv |
| Stockhom, Sweden | 19May20 | 1.104 | yes? | 7.3 | ? | newspaper |
| Birmingham, UK | 22May20 | 554 | no (health care worker= | 24.4 | high-sensitivity ELISA developed in-house | medrxiv |
There is preprint that lists some studies that I could not locate so far.
Prevalences should NOT be compared for methodological reasons.
No idea from where the NYT data originate.
Hubert von Goisern / Zabine in München
Wieviel Viren braucht es zur Infektion?
Einfach. Besser. Leben.
Mene mene tekel u-pharsin
Mene tekel – die Unheil verkündende Warnung der Propheten wurde noch nie gerne gehört. Die Propheten nehmen, wenn auch nur selten in den Kirchen über sie gepredigt wird, einen wichtigen Teil der alttestamentlichen Literatur ein ( προφήτης griechisch die „Fürsprecher“, „Sendbote“, „Voraussager“). Dazu gehören zum einen die vier großen Propheten Jesaja, Jeremia, Ezechiel und Daniel, dazu die “kleinen” Propheten des Zwölfprophetenbuches; aber auch Prophetinnen wie Debora. Mirjam und andere.
Propheten:innen bezogen ihre Legitimation als Gesandte Gottes während sich aus den überlieferten Aussagen ergibt, dass sie aus der intellektuelle Schicht des Volkes stammten, die komplexe Zusammenhänge deuten konnten. Wikipedia
Eine große Vielfalt altorientalischer Texte enthalten oder sind Weissagungen oder Prophezeiungen. Viele dienten dazu, eine Dynastie nachträglich als gottgewollt zu legitimieren. Einige führen sich auf ein Offenbarungserlebnis zurück und geben eine Gottesbotschaft an bestimmte Adressaten weiter. Die Sprecher sind meist im Umfeld des Königshofes und zentraler Staatskulte angesiedelt. Sie haben meist das Heil und Wohl der jeweiligen Herrscher zum Thema und richten sich nie direkt an das gesamte Volk oder die Völker. Sie kritisieren gelegentlich Einzelaspekte der Kultausübungen, aber massive Unheilsprophetie, Kritik an Königen, ihrer Politik und Sozialkritik fehlen.
Das trifft allerdings nicht für die alttestamentlichen Propheten:innen zu, die massive Kritik an König und Volk übten, so wibilex
Grundlegendes Vorbild für die literarische Form ist das Gerichtsverfahren, das in der prophetischen Verkündigung in übertragener Verwendung auftaucht – ähnlich wie die Botenrolle in der Botenformel. Das bevorstehende Unheil wird mit Hilfe des Modells des Gerichtsverfahrens gedeutet als richtendes und strafendes Handeln Gottes. Dieses Muster kommt auch in den Gerichtsworten an ein Kollektiv zur Anwendung.
Wenn man den Begriff der Propheten etwas weiter fasst, so fällt darunter auch die Totenklage und das Heilsversprechen. Worauf ich in der aktuellen Krise hinaus will? Es zeigt sich, dass unsere “Wissensgesellschaft” nur sehr begrenzt wissensbasiert ist, wenn die Politik jetzt mehr nach populistischen Strömungen statt nach wissenschaftlichen Ratschlag entscheidet. Damit meine ich nicht so sehr die 3000 Menschen, die sich gestern hier auf dem Marienplatz getroffen haben, die Corona Leugner, Anti-Vaxxer, Verschwörungstheoretiker und vereinzelte Psychopathen, aus einem breiten politischen Spektrum von FDP und AfD; ich meine damit mehr die Wissenschaftskollegen, die sich abschätzig über Virologen und Epidemiologen äussern. So musste ich gestern schon wieder auf den Einwand antworten, dass es in Deutschland keine Übersterblichkeit gibt
Erstens gibt es sie wenn auch nur leicht, zweitens haben wir gerade maximale Anstrengung hinter uns, sie zu vermeiden (deswegen liegen wir so viel besser als Bergamo, London oder New York), drittens gibt es positive Effekte des Shutdowns auch auf auslaufende Influenza, weniger Verkehr, etc bei vierten bekannten technischen Problemen (Meldeverzögerung, fehlenden Autopsien, fehlenden Virusnachweis).
Das “kreuzige ihn” ist offensichtlich nicht nur bei den Propheten des Alten Bundes erschallt sondern trifft nun auch uns moderne Weissager, die sich mehr auf Computermodelle beziehen. Jesaija wurde der Legende nach in zwei Teile zersägt; Jeremia kam in Haft, ging dann in Exil; Daniel wurde Tieren zum Frass vorgeworfen; Ezechiel der Legende nach gevierteilt.
Und noch eine interessante Parallele zu den Propheten damals und Wissenschaft von heute auf wibilex
In den meisten Fällen bedient sich ja die Gottheit eines Propheten, um einer dritten Partei etwas ausrichten zu lassen, weil diese nicht von sich aus dem Gotteswillen entspricht. Wird sie mit dem Propheten konfrontiert, so stellen sich in aller Regel Widerstände ein. Für die Adressaten, die die göttliche Sendung des Propheten nicht überprüfen können, ist es besonders verwirrend, wenn mehrere Propheten auftreten, deren Botschaften sich widersprechen.
Falsche Propheten:innen gab es also auch schon früher. Auch heute stellen sich falsche Propheten recht schnell heraus, man muss einfach nur ihre Prognosen mit etwas Zeitabstand überprüfen.
R leaflet – keep map in frame after closing info box
Although having some experience with leaflet before, it took me 5 hours to find out how to
(1) change the background color and
(2) re-center my map after the popup was panning the map basically out view. Here is my solution
leaflet(options = leafletOptions(
zoomControl = FALSE,
minZoom=6, maxZoom=6,
centerFixed = TRUE) ) %>%
addPolygons(data = ds,
fillColor = ~pal(AnzahlFall),
color="black", weight = 1,
fillOpacity = 0.7,
label = ~name_2,
popup = ~www,
popupOptions = popupOptions( autopan=FALSE, keepInView = TRUE ) ) %>%
htmlwidgets::onRender("
function(el, x) {
var myMap = this;
myMap.dragging.disable();
myMap.on('popupclose', function(e) { myMap.panTo( {lon: 10.26, lat: 51.1} ) });
var e = document.getElementsByClassName('leaflet-container');
e[0].style.backgroundColor = 'white';
}")
Mamaa!
Fit a Function
Here is the link to a great blog post about Derek Lowe
The nice thing about Derek’s talk was that it was really delivered from the other side of the fence, that of an accomplished and practicing medicinal chemist. Thus he wisely did not dwell too much on all the details that can go wrong in modeling: since the audience mainly consisted of modelers presumably they knew these already (No, we still can’t model water well. Stop annoying us!). Instead he offered a more impressionistic and general perspective informed by experience.
Why von Neumann’s elephants? Derek was referring to a great piece by Freeman Dyson (who I have had the privilege of having lunch with a few times) published in Nature a few years back in which Dyson reminisced about a meeting with Enrico Fermi in Chicago. Dyson had taken the Greyhound bus from Cornell to tell Fermi about his latest results concerning meson-proton scattering. Fermi took one look at Dyson’s graph and basically demolished the thinking that had permeated Dyson and his students’ research for several years.
Yes, you can fit an elephant by just four parameters.
I think the elephant goes back to the 2010 paper by Mayer and the Dyson/Fermi meeting to a 2004 paper by Dyson.
I can not not resist to add here another reference here after reading all the COVID-19 modelling: the Hand 2006 paper which says
A great many tools have been developed for supervised classification, ranging from early methods such as linear discriminant analysis through to modern developments such as neural networks and support vector machines. A large number of comparative studies have been conducted in attempts to establish the relative superiority of these methods. This paper argues that these comparisons often fail to take into account important aspects of real problems, so that the apparent superiority of more sophisticated methods may be something of an illusion.
Heinsberg und Tirschenreuth aus den Schlagzeilen, dafür Greiz, Coesfeld, Steinburg und Neuburg
Heute verschwindet Heinsberg und Tirschenreuth von der Corona Karte, wenn man die neue Definition “Neuinfektionen der letzten 7 Tage” nimmt. Ein grosser Erfolg der Massnahmen vor Ort.
Neu im Club dafür sind Greiz (Familienfeiern), die drei Schlachtereien Pforzheim Müller Fleisch, Coesfeld Westfleisch und Bad Bramstedt Vion, Esslingen war es eine Beerdigung, Neuburg eine Asylunterkunft, Rosenheim und Traunstein sind Altfälle von den Starkbierfesten.
RKI Situationsbericht von heute
The epidemiology controversy explained
It is not easy to understand the major controversy in epidemiology right now. But there is great piece at Boston Review “Model versus Evidence”
In one camp are infectious disease epidemiologists, who work very closely with institutions of public health. They have used a multitude of models to create virtual worlds in which sim viruses wash over sim populations. … A notable detractor from this view is Stanford’s John Ioannidis … This talk of “biased evidence” and “evidence-based interventions” is characteristic of the evidence-based medicine (EBM) community, a close relative of clinical epidemiology. … Public health epidemiologists and clinical epidemiologists have overlapping methods and expertise; they all seek to improve health by studying populations. Yet to some extent, public health epidemiology and clinical epidemiology are distinct traditions in health care, competing philosophies of scientific knowledge. Public health epidemiology, including infectious disease epidemiology, tends to embrace theory and diversity of data; it is methodologically liberal and pragmatic. Clinical epidemiology, by contrast, tends to champion evidence and quality of data; it is comparatively more methodologically conservative and skeptical.
I agree, they are more orthodox and not able to overcome the scepticism in their genes and therefore unable to cope with an emergent situation.

