Category Archives: Allergy

The Lancet and scientific integrity

We have learned in the past that the Lancet published editorials that clearly separated the journal from the publisher Elsevier

Reed Elsevier’s response is that the sale of military equipment is legal, government supported, and tightly regulated. However, The Lancet‘s collaborations in child survival and health-systems strengthening, for example, risk being tainted by Reed Elsevier’s promotion of the “selling process” of arms.

Of course you can’t sell weapons and distance yourself from selling weapons at the same time…

Die neue S3 Leitlinie Allergieprävention zu Vitamin D

This content has restricted access, please type the password below and get access.


Hass muss man sich verdienen, Mitleid gibt es geschenkt

Ein sehr schönes Interview im LJ mit Katharina Schüller(Mitautorin der „Unstatistik“), das mit vielen anderen Stimmen [1,2,3,4] mal wieder zeigt, wie schlecht unsere COVID-19 Datenlage in Deutschland ist und dabei auch meine Forderung vom März 2020 nach repräsentativen Daten wiederholt. Was es mit dem Titel auf sich hat? Es ist die Antwort in dem Interview auf die Frage

Macht Ihnen Ihre „Unstatistik“, speziell in Verbindung mit Corona, eigentlich viel Ärger?

Kann Milch vor Allergien schützen?

This content has restricted access, please type the password below and get access.


What did Sequana really find at Tristan da Cunha?

The Tristan da Cunha asthma study  was leading to patent US6087485A. The patent describes

highly significant linkage in the genome scan (p=0.0001 for history of asthma and p=0.0009 for methacholine challenge) … at D11S907, a marker on the short arm of chromosome 11.

D11S907 or  AFM109YA1 is a microsatellite marker located at 11p13 in a gene known as EHF (ETS homologous factor).  There should be 2 genes in close proximity of the marker: ASTH1I and ASTH1J.

ASTH1I and ASTH1J were detected by exon trapping. ASTH1I exons detected a 2.8 kb mRNA expressed at high levels in trachea and prostate, and at lower levels in lung and kidney …
ASTH1J exons detected a 6.0 kb mRNA expressed at high levels in the trachea, prostate and pancreas and at lower levels in colon, small intestine, lung and stomach.

The sequences of  table 2 in the patent are sufficient now to locate ASTH1I and ASTH1J. Continue reading What did Sequana really find at Tristan da Cunha?

25 years Transatlantic Airway Conference 1997 on asthma genetics in Key Biscayne

The conference series started in 1986 while the 12th conference was organized by Jeff Drazen with local support of Adam Wanner.

 

Sponsored by Boehringer Ingelheim, the participant list is the WHO is WHO in pulmonary genetics at that time: Bleecker, Meyers, Woolcock, Weiss, Burrows, Postma, Kauffmann, Dizier, LeSouef, Blumenthal, Banks-Schlegel, Slutsky, Zamel, Ober, Bousquet, Vercelli, Barnes, Adcock, Dahlen, Pauwels, Lewitt, Aron, Martinez, Cookson, Moffatt, Rosenwasser, Liggett, Rich, Papadopoulos, Levitt, Holgate, Elston, Morton and Marsh. Many of them do not live any more [1,2,3,4,5], some have made big careers [1,2], others have been fallen somewhat into disgrace [1,2,3]  and many already retired. Continue reading 25 years Transatlantic Airway Conference 1997 on asthma genetics in Key Biscayne

Censored IL33 research

the AMGEN website …

Ausfahrt freihalten

Da wird von Leuten „Freiheit“ eingefordert, die zugleich proklamieren, alle, die nicht ihrer Meinung wären, gehörten an die Wand gestellt. Die gleichen Leute haben kein Problem damit, Schutzsuchenden den Grenzübertritt zu verwehren und sie erfrieren oder ertrinken zu lassen.

Statt eines weiteren Essays zur Perversion des Freiheitsbegriffes  damals und heute hier ein Bild ohne Worte.

 

Rare variants in GSDMA/B /IKZF3 but not in ORMDL3 are relevant for asthma

It was a heated debate (paper, blog) that was open until a most recent study that I am depicting here in more detail.

IKZF3
ORMDL3
GSDMB

Maybe there is an interaction by methylation?

The  analysis of  SNP effects is ongoing while it now looks like ORMDL3 SNPs were just hitchhikers, at least what I see.

 

Addendum 4.9.2023

Maybe there is even a vitamin interaction?

Wer glaubt, durch eine Infektion sein Immunsystem zu trainieren…

Nachdem ich viele Jahre damit verbracht habe  die Hygiene Hypothese der Allergien zu widerlegen, dass

die „Auseinandersetzung“ des kindlichen Organismus mit Schmutz und Keimen [ist ]eine wichtige Voraussetzung für eine normale Entwicklung des Immunsystems ist … Gründliche oder sogar übertriebene Hygiene führt nach dieser Theorie dazu, dass das Immunsystem nur eingeschränkt aktiviert wird. Es ist dadurch „unterbeschäftigt“ und tobt sich quasi mit der Ausbildung allergischer Erkrankungen aus.

bin ich dem prominenten Beistand nun doch sehr dankbar für seine Aussage

Bonuslinks

Merchandising  (fun)

*** Artikel  (englisch)

*** Blog (deutsch)

 

19.12.2023 Update

Warum hinter “Immunschuld” ein Missverständnis steckt

Nachholeffekte Grund für viele Ansteckungen

 

Back to the roots

Rewriting a local Python notebook now to Colabs (as I don’t have an eGPU and therefore also no CUDA support in macOS) I am now again restricted by a daily timeout…

This reminds me so much back to 1989/1990 when we programmed SAS on an IBM mainframe under VM/CMS.  I usually went there early in the morning just to reserve my disk space :-)  In the evening it was all gone just like Colabs nowadays…

 

Computermuseum: SAS files of https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1793604/
***                                                                             
* Auswertung des genetischen Einflusses...;                                                            
cms fi data disk dummy dummy e;                                                 
data a; set data.ges_crit(keep=                                        
asthma frage  f1ekzem f33heu f36ekzem);                                                       
***

BTW without an expensive GPU I had to use our HPC now. Will try a Jetson Nano or Google Coral in the near future as this seems to be more energy friendly.